Zoekmachines voeren geen Flash uit; delen van de website die gemaakt of gegenereerd worden door middel van Flash wordt door Google niet geïndexeerd. Het is hierbij dus van belang dat er geen content, belangrijke links of andere website elementen, zoals bijvoorbeeld de menu-items, door middel van Flash ingeladen worden. Daarnaast worden website elementen welke zijn gemaakt in Flash ook niet getoond op mobiele devices zoals de tablet en smartphone. Om indexatie problemen door zoekmachines te voorkomen is het dus raadzaam de belangrijkste elementen van je website niet in Flash te maken.